洁净室的建造，通常是在土建框架主体结构营造的大空间内，采用符合要求的装修材料，根据工艺要求进行分隔、装修成满足各类使用要求的洁净室。
洁净室内的污染控制需净化空调专业与自动化控制专业共同完成，若是医院洁净手术室，还需把医用气体如氧气、氮气、二氧化碳、氧化亚氮等送入洁净手术室；若是制药企业的洁净车间，还需要工艺管道及排水专业的配合，把药品生产所需的去离子水及压缩空气送入洁净室，把生产废水排出洁净室。可见，洁净室的建造要如下专业及工程共同配合完成。
土建专业建造洁净室的外围防护结构净化空调专业通过净化空调设备、净化风管及阀门附件等组成净化空调系统来控制室内温度、湿度、洁净度、风速、压差及室内空气品质等参数。自动控制及电气专业 负责洁净室照明配电、动力配电、灯具、开关插座等器具的安装；配合净化空调专业，实现温度、湿度、送风量、回风量、排风量、室内压差等参数的自动控制。工艺管道专业 通过管道设备及其附件把洁净室所需要的各种气体、液体按要求送入室内，输配管道大多采用镀锌钢管、不锈钢管及铜管。在洁净室内明装的管道均需要求采用不锈钢管道。对于去离子水管道，还要求采用内外抛光的卫生级不锈钢管。特种装修装饰专业 特种指洁净室装修装饰不同于民用建筑。民用建筑注重装饰环境的视觉效果及丰富多彩的、错落有致的层次感、有欧式风格、中式风格等。而洁净室的装修装饰对材料要求极为严格：不产尘、不积尘、易清洗、耐腐蚀、耐消毒液擦洗、无接缝或少接缝（接缝应严密平整）对装修装饰工艺要求更为严格，强调壁板平整、接缝严密且平整光滑，不许有凹凸造型，所有阴角和阳角全部做成R大于50mm的圆弧角；窗户应与墙面齐，不应设置凸出墙面的踢脚；照明灯具应采用带密闭罩的净化灯吸顶安装（安缝隙应密封）；地面应采用不产尘材料整体制作，应平整、光滑、防滑、防静电。
洁净室的建造是多专业、多工种，各专业及工种之间需要密切配合的一项系统工程，哪个环节出现问题，均会影响洁净室的建造质量。
