国家秘密载体印制资质申请单位相关材料准备完毕后，须向本地资质受理部门提交材料。具体来说，申请甲级资质的，应当向工商注册地省（自治区、直辖市）保密行政管理部门提出申请；申请乙级资质的，应当向工商注册地市（地、州、盟）保密行政管理部门提出申请。
第一，书面初审。书面初审，是指资质受理部门对资质申请单位提交材料的完备性和真实性进行审查的工作。按照规定，省（自治区、直辖市）保密行政管理部门和市（地、州、盟）保密行政管理部门收到申请材料后，应当在10个工作日内完成材料的完备性和真实性审查，符合申请条件的，按照审批权限分别报送有关保密行政管理部门；不符合申请条件的，退回申请材料，并说明理由，由申请单位补充相关材料。保密行政管理部门收到申请材料后，应当在5个工作日内对申请材料进行书面审查。符合要求的，发出受理通知书。不符合要求的，书面告知申请单位。
申请单位要想顺利通过书面审查，必须提供完备的申请材料，并确保材料的真实性。按照规定，申请单位应当填写《国家秘密载体印制资质申请书》，并提供以下材料：企业营业执照或者事业单位法人证书；组织机构代码证书；从事印刷、复制等经营活动的许可证明；企业事业单位章程；生产经营和办公场所的产权证书或者租赁合同；国家秘密载体印制、保管场所平面图，等等。
对于以上涉及申请条件的材料，如营业执照、办公场所产权证明、保密管理制度等，必须提交。对于体现申请单位科研、学术、管理能力的材料，如科研项目、科技奖励、知识产权等，如不提供，书面审查相关审查项不得分。由于资质申请材料可能涉及国家秘密信息，建议当面提交，不要采取邮寄快递等传递方式。资质申请单位提交材料后，如果发生事项变更的，应按照要求填写事项变动报告表和相关情况报告。
第二，现场审查。现场审查，是指对通过书面审查决定受理的资质申请单位，保密行政管理部门组织人员按照法定程序和标准进行实地审核，对该资质申请单位是否符合其申请的国家秘密载体印制资质条件作出正确评价的过程。一般包括组织涉密人员进行保密知识测试，进行实地检查并作出检查记录，对现场审查情况进行评议，形成审查意见等。
实际工作中，由于准备不足导致条件不具备等原因，不少申请单位现场审查并不能顺利通过。第一次现场审查未通过的申请单位，应在30个工作日内提交整改报告，保密行政管理部门视整改完成情况组织开展复查，超过时限的，必须重新申请。现场审查存在基本项不符合的资质单位，应在50个自然日内提交整改报告，超过时限的必须重新申请。
如因客观原因，确实无法接受现场审查的，可向审査机构提交书面延期申请，详细说明延期原因及可接受审查时间。经国家或省(区、市)资质管理部门同意，延期Zui长不超过1个月。超过时限的，应当重新提出申请。
